生物顯微鏡是十分常見的一種顯微鏡，在很多實驗室中都可以見到，主要是用來觀察生物切片、生物細胞、細菌以及活體組織培養、流質沉淀等的觀察和研究，同時可以觀察其他透明或者半透明物體以及粉末、細小顆粒等物體。生物顯微鏡供醫療衛生單位、高等院校、研究所用于微生物、細胞、細菌、組織培養、懸浮體、沉淀物等的觀察，可連續觀察細胞、細菌等在培養液中繁殖分裂的過程等。在細胞學、寄生蟲學、腫瘤學、免疫學、遺傳工程學、工業微生物學、植物學等領域中應用廣泛。
生物顯微鏡的分類介紹：
1. 按照定位級別分類。可以分為學生級、實驗級、研究級生物顯微鏡。
2. 按照目鏡的個數分類。可以分為單目型、雙目型、三目型生物顯微鏡。
3. 按目鏡和移動臺的相對位置分類。可以分為正置生物顯微鏡和倒置生物顯微鏡。正置(常規)生物顯微鏡的物鏡在移動臺的上方，倒置生物顯微鏡的物鏡在移動臺的下方。
4. 按成像原理分類。可以分為光學生物顯微鏡和電子生物顯微鏡。
生物顯微鏡在使用過程中，鏡頭內部視野不清晰是經常出現的一個問題，導致這個問題的直接原因是鏡頭受到污染，如鏡頭內部產生了霉斑或者塵埃，需要對目鏡和物鏡等進行清洗，清洗目鏡和物鏡都需要把鏡片拆下來再清洗，對于目鏡而言，把目鏡直接拆下來并清洗即可，但是對于物鏡而言，拆卸的過程就比較復雜了，原因是物鏡的內部結構很復雜，物鏡內鏡片的疊放層次和順序都有自己的規律，因此清洗完物鏡的鏡片之后，必須嚴格按照物鏡鏡片原來的位置重新安裝物鏡鏡片。
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